Los Programas de Posgrado de la Universidad Federal Rural de Pernambuco se rigen por el Reglamento General de Posgrado. Administrativamente, todos los programas están compuestos por una Oficina de Coordinación, una Secretaría y un Consejo de Coordinación Docente (CCD), este último un órgano colegiado integrado únicamente por el profesorado permanente del Programa.
Actualmente, el PPGBEA cuenta con:
Oficina de Coordinación 2025-2027
Coordinador: Prof. Paulo José Duarte Neto
Suplente Temporal: Prof. Frank Sinatra Gomes da Silva
Secretario: Marco Antônio Gomes dos Santos
Junta de Coordinación Didáctica
Presidente:
Profesor Paulo José Duarte Neto
Frank Sinatra Gomes da Silva (Vicepresidente)
Representantes:
Frank Sinatra Gomes da Silva
Marco Antônio Gomes dos Santos (Representante de los Técnicos Administrativos)
Antonio Samuel Alves da Silva
Tiago Alessandro Espínola Ferreira
Guilherme Rocha Moreira
Josimar Mendes de Vasconcelos
José Antonio Aleixo da Silva
Viviane Moraes de Oliveira
Borko Stošić
Tatijana Stosic
Moacyr Cunha Hijo
Suplentes
Wilson Rosa de Oliveira Junior
Rômulo Simões Cezar Menezes
Jáder da Silva Jale
Luiz Antonio Martinelli
Representante Estudiantil:
Wenderson Gomes Barbosa (Representante Estudiantil)
Walfrido Siqueira Campos Junior (Suplente)
Además de estos, el programa cuenta con otros comités, como el Comité de Becas, el Comité de Evaluación del Profesorado, el Comité de Internacionalización, etc., que son designados por el coordinador y aprobados por la Junta Directiva cuando es necesario.